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Título en el idioma original: “Updated compendium of genes and variants associated with congenital hypogonadotropic hypogonadism: systematic review, classification pipeline, and network analysis”
Breve resumen:
El Hipogonadismo Hipogonadotropo Congénito (CHH) constituye un desafío diagnóstico mayor en la endocrinología pediátrica y reproductiva debido a su heterogeneidad genética. Con el avance de la secuenciación de próxima generación (NGS), el número de genes candidatos reportados ha crecido exponencialmente, dificultando a menudo la distinción entre variantes causales y hallazgos sin relevancia clínica clara. En este contexto, para avanzar en la comprensión del CHH, el objetivo de este trabajo fue perfeccionar el catálogo de genes y variantes causales. El trabajo presenta una revisión sistemática actualizada y un proceso de clasificación de genes y variantes asociadas con el CHH.
La revisión sistemática recuperó 352 estudios científicos, documentando a 1937 pacientes portadores de un total de 2603 variantes, de las cuales 1518 eran únicas, distribuidas en 143 genes. Para la reclasificación e interpretación automática de variantes se desarrolló una plataforma estandarizada y reproducible para la anotación y clasificación de variantes, basada en recomendaciones y directrices internacionales. Se creó CHH_vip, un proceso computacional (pipeline), que integra datos de la base de datos y fuentes externas. Tras la reclasificación, se identificaron cambios de relevancia clínica en las clasificaciones. Se llevó a cabo el análisis de los tipos de variantes genéticas asociadas con CHH y su distribución en las categorías de clasificación. Por último, se aplicaron análisis de redes génicas y de enriquecimiento de términos para generar paneles de genes específicos de la enfermedad.
El estudio mejora la comprensión del panorama genético del CHH y proporciona herramientas para un mejor diagnóstico. Se creó una base de datos depurada y de acceso público. La implementación de paneles de genes curados, junto con una plataforma reproducible para la compilación e interpretación de datos de variación, podría optimizar los procesos de filtrado y clasificación, reduciendo así el tiempo de respuesta diagnóstica.
La base de datos CHH_vd se encuentra disponible públicamente en el repositorio de CONICET (URL:http://hdl.handle.net/11336/270039).
El pipeline bioinformático (CHH_vip) se encuentra disponible en https://github.com/fginob1/HNRG_CHH_Rev_Sist.
Autores: Brunello FG, Castro S, Zaiat J, Sansó G, Izquierdo A, Urrutia M, Rey RA, Martí M, Grinspon RP, Tellechea ML.
Cita: Brunello FG, Castro S, Zaiat J, Sansó G, Izquierdo A, Urrutia M, Rey RA, Martí M, Grinspon RP, Tellechea ML. Updated compendium of genes and variants associated with congenital hypogonadotropic hypogonadism: systematic review, classification pipeline, and network analysis. Hum Mol Genet. 2026 Feb 23;35(5):ddag007. doi: 10.1093/hmg/ddag007
https://doi.org/10.1093/hmg/ddag007
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